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数据挖掘—miRNA调节网络的构建

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由于人类的基因数量巨大,miRNA作为调控这些基因表达的非编码RNA,其与基因的关系非常复杂。当前基因样本数目高达两万多维,随着维数的增加,获取基因与miRNA之间的关系的难度也随之增加。近年来关于基因和miRNA之间关系的研究成为生物信息学的一个热点。

研究者们发现众多疾病间存在很多共性,比如某些基因和miRNA在多种疾病中都有相似的表达,需要通过一定方法识别这些疾病中相关的miRNA和基因的调控关系。

目前建立两者的调控关系方法有很多,包括数据库比对,算法的运用,实验的验证等等。

这些都会通过详细的介绍传递给大家。

并会通过具体的操作向大家演示如何构建两者的关系。

相较于之前推出的《豪斯医生基因数据挖掘》和《WGCNA详解》,此次课程在内容上进行了延伸,将重点回到了非编码RNA的调控网络上。这过程中,不仅会重新温故之前的知识,又将WGCNA作为一种新的算法构建miRNA与mRNA的关系。

具体地,你将进一步了解非编码RNA数据的下载和处理,WGCNA的理论和操作,数据库的比对,cytoscape的灵活玩转,还有R语言的基本语法。该课程的学习会为大家在科研的道路中增加新的助力。

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THE END
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